Systemanvendelse for institutioner, der omfattes af § 2, stk. 1, nr. 2-4, aftales mellem vedkommende ministerium og Moderniseringsstyrelsen. Rigsrevisionen orienteres om sådanne aftaler.
Stk. 2 Selvejende institutioner omfattet af § 2, stk.1, nr. 2-3, er forpligtet til at anvende Moderniseringsstyrelsens betalingssystemer til modtagelse af tilskud og til udbetaling af løn, i det omfang de anvender det i § 11, stk. 2, nævnte system lønområdet på, men kan også anvende betalingssystemerne til andre betalinger.
Stk. 3 Institutioner, omfattet af § 2, stk.1, nr.. 4, er forpligtede til at anvende det i § 11, stk. 1, nævnte koncernsystem og det i § 11, stk. 2, nævnte betalingssystem i forbindelse med administrationen af bevillingerne. Institutionerne kan også anvende betalingssystemet til andre betalinger.